1、最后结局是日嘉想和有正一起逃到国外去，有正却坚持让日嘉自首，日嘉不同意，有正威胁她不自首就朝她开枪，有杰出来阻止他，把枪踢到了日嘉那里，然后日嘉说她爱错人了，然后就拿枪自杀了。最后有正因为日嘉的死而辞职了，一个人静静地坐在椅子上，喝了口果汁，回忆起了与日嘉在一起的日子，睡着了。(一说自杀了)。
2、最后的电视镜头给了男主手部头部放松的特写，目的在于暗示他自杀的结果。因为如果一个人睡着了，是不必特写手部头部放松的镜头的。
3、有正等人及商场的市民被ATF安排到医院接受检查，竟然发现身体一切正常，并没有受到生化武器感染。礼谦亦在新闻报道中得知事件无人受到病毒感染，便赶回药厂调查，发现日嘉及人质已经在礼谦不在时逃走。
4、而电脑上的重要数据亦被人全数删除。礼谦意识到可能是日嘉在炸弹上做手脚，才令计划失败，日嘉成功逃走后，便回到自己的家收拾母亲的遗物，却因此被礼谦发现并截获。
叛逃剧情简介
香港作为国际大都会，随时有可能会受到恐怖袭击。为了防止境内可能出现的恐怖活动，反恐特勤队于2009年成立。成员全由警队内部招募，是精英中的精英，既有高智能重装部队的新鲜感，又有纪律部队的男儿豪情气概。多名来自SDU、PTU、ASU、G4和重案组等不同部门的精英，经过严格筛选，成功考入特勤队，接受密集式训练，包括、射击、体能、爆炸品处理、枪械等，成为世界级水平的重装精锐部队，反恐特勤队。众人由训练到任务行动。面对不同案件及危机处理，由误会到了解，建立同胞间的信赖及友谊，刻划出一段段队员间出生入死、肝胆相照的动人故事。
