学生专属机票开放对象为国内全日制在校大学生，符合条件的学生，可通过南航官网活动页面填写身份信息并提交申请，注册成功后，就可持有效证件前往就近的南航营业点现场校验，审核通过后即可在南航官网上购买学生专属4.5折起的机票，购票有效期为学生证的有效期。
服务标准
机上服务
除了头等舱、商务舱及经济舱的设置，南航于2010年3月18日在其国内航线上正式推出高端经济舱，成为中国首家在客机上增设高端经济舱的航空公司。新增设的高端经济舱比普通经济舱的座位多出40%的空间，将原经济舱座椅的前后间距由31英寸扩大为35至37英寸，并根据机型大小设置了24至53个高端经济舱座位，通过加装门或隔帘分离出专门的区域。共有约300架南航客机在2010年7月前完成改造，总计7000个高端经济舱座位投入市场。
南航在其部分长程客机上提供便携式机上娱乐设备(Portable Multimedia Device，简称PMD)，共设有空中影院、电视剧场、音乐时空、蓝天书屋等8个栏目。其余多数客机则维持提供广播制式的音频及视频系统。机上阅读物主要有南航官方发行的《南方航空》、《往来》、《空中之家》(全英文)和《南方航空报》等，其中《南方航空》创刊于1985年，现每月平均发行量达到22万册。 国际航班还提供机上免税品售卖服务，品种包括香烟、化妆品及酒类。
登机
南航的登机手续除了在人工柜台办理外，亦可通过机场自助设备、登陆南航网站和发送手机短信办理。机场自助设备在2009年6月29日起逐渐更换为采用通用自助服务(Common Use Self-Service，“CUSS”)平台的NCR TouchPort自助值机亭。这种值机设备不仅提供为团体、散客办理乘机手续的服务，更可进行航班信息查询、里程补登、电子登机牌扫描以及里程查询等多项延伸服务。 网络办理登记手续则开通了由中国境内61座城市及境外的汉城和吉隆坡出发的航班。
俱乐部
南航的飞行常客奖励计划是“南航明珠俱乐部”。明珠俱乐部会员除了在南航和天合联盟会员航空的航班上累积和兑换里程，还可在四川航空、中华航空等航空合作伙伴的航班上累积和兑换里程，所累积里程均可记入明珠精英会员升级里程/航段中。此外，明珠俱乐部还与其他酒店、汽车租赁、信用卡、电信公司等合作，提供里程兑换及增值服务。
南航亦在各主要的大中型机场设立了贵宾休息室，提供阅读室、健身室、浴室、酒吧及餐厅等设施。在与南航签有贵宾休息室使用协议的机场，乘客若是明珠金、银卡会员或者持有头等舱机票、公务舱机票，即可使用南航的贵宾休息室。 南航明珠金卡会员还可额外邀请一名当天同是乘坐南航航班的乘客共同进入头等舱休息室。
